Centrul Antiterorist al SIS al RM, colaborează activ, la nivel național, cu autoritățile publice competente, în vederea realizării măsurilor practice de politică antiteroristă.
Totodată, procesul de prevenire și combatere a terorismului este irealizabil fără o cooperare la nivel internațional. În acest context, Centrul Antiterorist al SIS al RM desfășoară un schimb pertinent de informații și bune practici cu partenerii din străinătate, colaborînd cu structurile specializate din Bulgaria, Germania, SUA, Franța, România, CSI şi alte state sau organizații regionale și internaționale.